Home / Publications

Publications

Google Scholar | ORCID | ResearchGate | ResearcherID | Curriculum Vitae

PEER-REVIEWED PUBLICATIONS IN SCI/SCIE JOURNALS

  1. Le DT, Yoon M-Y, Kim YT and Choi JD (2003). Roles of conserved methionine residues in tobacco acetolactate synthase. Biophys. Res. Commun. 306 (4): 1075-1082.
  2. Le DT, Yoon M-Y, Kim YT and Choi JD (2004). Homology modeling and examination of the active site of tobacco acetohydroxy acid synthase. Biophys. Res. Commun. 317 (3), p: 930-938.
  3. Jung SM, Le DT, Yoon SS, Yoon M-Y, Kim YT and Choi JD (2004) Amino Acid Residues Conferring Herbicide-Resistance in Tobacco Acetohydroxy Acid Synthase. J. 383 (1), p: 53-61.
  4. Le DT, Yoon M-Y, Kim YT and Choi JD (2005) Two consecutive aspartic acid residues conferring herbicide resistance in tobacco acetohydroxy acid synthase. BBA-Proteins and Proteomics 1749, p:103-112.
  5. Le DT and Choi J-D (2005) FAD-independent and herbicide-resistant mutants of tobacco acetohydroxy acid synthase. Korean. Chem. Soc. 26 (6), p:916-920.
  6. Le DT, Yoon M-Y, Kim YT and Choi JD (2005) Roles of three well-conserved arginine residues in mediating catalytic activity of Tobacco Acetohydroxy acid Synthase. Biochemistry (Tokyo) 138 (1), p:35-40
  7. Le DT, Lee HS, Chung YJ, Yoon M-Y, Choi J-D (2007) Virtual Screening of Tubercular Acetohydroxy Acid Synthase Inhibitors by Analysis of Its Structural Models. Bull. Korean. Chem. Soc. 28 (6), p:947-952
  8. Kalme S, Pham CN, Gedi V, Le DT, Choi JD, Kim S-K and Yoon M-Y (2008) Inhibitors of Bacillus anthracis acetohydroxyacid synthase. Enzyme and Microbial Technology, 43:270-275
  9. Le DT, Liang X, Fomenko DE, Raza AS, Chong C-K, Carlson BA, Hatfield DL and Gladyshev VN (2008) Analysis of methionine/selenomethionine oxidation and methionine sulfoxide reductase function using methionine-rich proteins and antibodies against their oxidized forms. Biochemistry 47 (25), p:6685-6694.
  10. Lee BC, Le DT and Gladyshev VN (2008) Mammals reduce methionine-S-sulfoxide with MsrA, are unable to reduce methionine-R- sulfoxide, and this function can be restored with a yeast reductase. Biol. Chem. 283 (42), p: 28361-28369
  11. Le DT, Lee BC, Marino SM, Zhang Y, Fomenko DE, KayaA, Hacioglu E, Kwak G-H, Koc A, Kim H-Y, and Gladyshev VN (2009) Functional analysis of free methionine-R-sulfoxide reductase from Saccharomyces cerevisiae. Biol. Chem. 284 (7), p: 4354-4364
  12. Tran ST, Le DT, Kim Y-C, Shin M and Choi J-D (2009) Cloning and characterization of Phosphoglucose Isomerase from Sphingomonas chungbukensis DJ77. BMB Reports 42 (3), p:172-177
  13. Tran ST, Le DT, Kim Y-C, Shin M and Choi J-D (2009) Cloning and characterization of Phosphomanose Isomerase from Sphingomonas chungbukensis DJ77. BMB Reports 42 (8), p:523-528
  14. Le DT, Choi J-D, Tran LS (2010). Amino acids conferring herbicide resistance in tobacco acetohydroxyacid synthase. GM Crops 1(2):62-67 (invited review)
  15. Lee GC, Jeon ES, Kim WS, Le DT, Yoo JH and Chong CK (2010) Evaluation of a rapid diagnostic test, NanoSign(R) Influenza A/B Antigen, for detection of the 2009 pandemic influenza A/H1N1 viruses. Virology J 7:244
  16. Le DT, Uehara-Ichiki T, Shimizu T, Nezu O, Choi I-R, Omura T, Sasaya T (2010) Molecular detection of nine rice viruses by a reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification assay. J Virol Meth 170:90-93
  17. Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Mochida K, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K and Tran PLS (2011) Genome-wide expression profiling of soybean two-component system genes in soybean root and shoot tissues under dehydration stress. DNA Res. 18:17-29
  18. Nishiyama R, Watanabe Y, Fujita Y, Le DT, Kojima M, Werner T, Vankova R, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Kakimoto T, Sakakibara H, Schmülling T, Tran LS (2011). Analysis of cytokinin mutants and regulation of cytokinin metabolic genes reveals important regulatory roles of cytokinins in drought, salt and ABA responses, and ABA biosynthesis. Plant Cell 23: 2169–2183
  19. Lee GC, Jeon ES, Le DT, Kim TS, Yoo JH, Kim HY and Chong CK (2011) Development and Evaluation of a Rapid Diagnostic Test for P.falcifarum, P.vivax, and Mixed-Species Malaria Antigens. Am J Trop Med Hyg 86:989-993
  20. Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Mochida K, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K and Tran PLS (2011) Genome-wide survey and expression analysis of the plant-specific NAC transcription factor family in soybean during development and dehydration stress. DNA Res.18:263-276
  21. Nishiyama R, Le DT, Watanabe Y, Tanaka M, Seki M, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K and Tran PLS (2011) Transcriptome analyses of a salt-tolerant cytokinin-deficient mutant reveals differential regulation of salt stress response by cytokinin deficiency. PLOS ONE 7(2): e32124
  22. Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Vankova R, Tanaka M, Seki M, Ham le H, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS (2012) Identification and Expression Analysis of Cytokinin Metabolic Genes in Soybean under Normal and Drought Conditions in Relation to Cytokinin Levels. PLOS ONE 7(8): e42411.
  23. Le DT, Aldrich DL, Valliyodan B, Watanabe Y, Ha CV, Nishiyama R, Guttikonda SK, Quach TN, Gutierrez-Gonzalez JJ, Tran LS, Nguyen HT (2012) Evaluation of Candidate Reference Genes for Normalization of Quantitative RT-PCR in Soybean Tissues under Various Abiotic Stress Conditions. PLOS ONE 7(9): e46487.
  24. Liang X, Kay A, Zhang X, Le DT, Hua D, Gladyshev VN (2012) Characterization of methionine oxidation and methionine sulfoxide reduction using methionine-rich cysteine-free proteins. BMC Biochemistry13:21
  25. Le DT and Le HH (2013) Comments on “Long term toxicity of a Roundup herbicide and a Roundup-tolerant genetically modified maize”. Food Chem Toxicol. 53:443-444
  26. Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Tanaka M, Seki M, Ham le H, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS (2012) Differential gene expression in soybean leaf tissues at late developmental stages under drought stress revealed by genome-wide transcriptome analysis. PLOS ONE 7(11):e49522
  27. Ha CV, Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Tran UT, Nguyen DV and Tran PLS (2013) Characterization of the newly developed soybean cultivar DT2008 in relation to the model variety W82 reveals a new genetic resource for comparative and functional genomics for improved drought tolerance. BioMed Res. Int., 2013, Article ID 759657, 8 pages
  28. Le DT*, Tarrago L, Wantanabe Y, Kaya A, Lee BC, Tran UT, Nishiyama R, Gladyshev VN* and Tran LSP* (2013) Diversity of plant methionine sulfoxide reductases B and evolution of a form specific for free methionine sulfoxide. PLOS ONE8(6):e65637
  29. Ha CV, Le DT, Nishiyama R, Watanabe Y, Sulieman S, Tran UT, Mochida K, Nguyen DV Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K and Tran PLS (2013) The ARF transcription factor family in soybean: genome-wide identification and expression analyses during development and water stress. DNA Res. 20:511-524
  30. Le DT, Chu HD and Sasaya T (2015) Creation of transgenic rice plants producing small interfering RNA of Rice tungro spherical virus. GM Crops & Food, 6:1, 47-53
  31. Ha CV, Watanabe Y, Tran UT, Le DT, Tanaka M, Nguyen KH, Seki M, Nguyen DV and Tran L (2015). Comparative analysis of root transcriptomes from two contrasting drought-responsive Williams 82 and DT2008 soybean cultivars under normal and dehydration conditions.  Plant Sci. 6:551.
  32. Vu NT, Pardo JM, Avares E, Le HH, Wyckhuys K, Nguyen KL and Le DT (2016) Establishment of a Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assay for the Detection of Phytoplasma-Associated Cassava Witches’ Broom Disease. Appl Biol Chem, 59:151-156
  33. Chu HD, Nguyen K-L, Watanabe Y, Le DT* and Tran PLS* (2016) Expression analyses of soybean genes encoding methionine-R-sulfoxide reductase under various conditions suggest a possible role in the adaptation to stress. Appl Biol Chem, 59:681-687
  34. Chu HD, Le QN, Nguyen HQ and Le DT (2016) Genome-wide analysis of genes encoding methionine-rich proteins in Arabidopsis and soybean suggesting their roles in the adaptation of plants to abiotic stress. Int J Genomics, 2016:5427062
  35. Le DT, Chu HD, Le QN (2016) Improving nutritional quality of plant proteins through genetics engineering.  Genomics, 17(3), 220-229 (invited review)
  36. Vu NT and Le DT (2016) Progress of loop-mediated isothermal amplification techniquein molecular diagnosis of plant diseases. Biol. Chem. 60(20): 169-180 (invited review)
  37. Le DT, Nguyen KL, Chu HD, Vu NT, Pham TTL, Tran LP. (2018) Function of the evolutionarily conserved plant methionine-S-sulfoxide reductase without the catalytic residue. Protoplasma. 255(6):1741-1750.
  38. Nguyen KH, Mostofa MG, Li W, Ha CV, Watanabe Y, Le DT, Nguyen PT, Tran LSP (2018) The soybean transcription factor GmNAC085 enhances drought tolerance in Arabidopsis. Environ Exper Bot,151:12-20
  39. Hoang TT, Nguyen NB, Nguyen HP, Vu LQ, Vu HT, Truong PTB, Le DT, Nguyen LH and Duong NT (2018) A System for Large Scale Production of Chrysanthemum Using Microponics with the Supplement of Silver Nanoparticles under Light-Emitting Diodes. Scientia Horticulturae. 232:153-161
  40. Chu HD, Nguyen KH, Watanabe Y, Le DT, Pham TLT, Mochida K, Tran PLS (2018). Identification, Structural Characterization and Gene Expression Analysis of Members of the Nuclear Factor-Y Family in Chickpea (Cicer arietinum L.) under Dehydration and Abscisic Acid Treatments. Int J Mol Sci, 19, 3290.
  41. NP Huy, VQ Luan, NB Nam, HT Tung, VT Hien, Le DT and DT Nhut (2019) Strategies for the Regeneration of Paphiopedilum callosum through Internode Tissue Cultures Using Dark–light Cycles. HortScience 54 (5), 920-925
  42. L Niu, HD Chu, CD Tran, KH Nguyen, HX Pham, DT Le, W Li, W Wang, TD Le, LSP Tran (2020). The GATA Gene Family in Chickpea: Structure Analysis and Transcriptional Responses to Abscisic Acid and Dehydration Treatments Revealed Potential Genes Involved in Drought Adaptation. J Plant Growth Regul, 39: 1647–1660.
  43. Lee J-H, Doan TA, Park YJ, Hoa HTM, Phuong PH, Le DT, Hung NH, Tran QT, Lee H-S, Ryu JH, Yoo J-Y, Cuong TV. (2020) Synthesis and Photocatalytic Activity of β-Ga2O3 Nanostructures for Decomposition of Formaldehyde under Deep Ultraviolet Irradiation. Catalysts. 10:1105.
  44. Hoang XLT, Chuong NN, Hoa TTK, Doan H, Van PHP, Trang LDM, Huyen PNT, Le DT, Tran LP, Thao NP (2021). The Drought-Mediated Soybean GmNAC085 Functions as a Positive Regulator of Plant Response to Salinity. Int J Mol Sci. 22(16):8986. doi: 10.3390/ijms22168986.

PEER-REVIEWED PUBLICATIONS IN VIETNAMESE JOURNALS

(IN ENGLISH OR IN VIETNAMESE LANGUAGES)

  1. Le DT, Vu NK and Vu VV (2001). Bước đầu nghiên cứu bảo quản rau cải xanh và xà lách trồng bằng phương pháp thủy canh. Tap chi Sinh hoc, 23 (2): 60-63.
  2. Nguyen DV, Le HH, Choi JD and Le DT (2013) Tái thiết kế enzyme Acetohydroxyacid synthase phục vụ tạo cây trồng chuyển gen kháng thuốc trừ cỏ. Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, 8:43-47
  3. Nguyễn Văn Đồng, Nguyễn Anh Vũ, Lê Tiến Dũng, Tống Thị Hường, Lê Thị Ngọc Quỳnh, Lê Thị Lý, Vũ Anh Thu, Vũ Hoàng Nam, Vũ Thế Hà, Lê Huy Hàm (2014). Kết quả tạo mô sẹo phôi hóa phục vụ cho chuyển gien vào cây sắn. Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn, 15:29-35
  4. Le DT, Nguyen DV, Pham TL, Le HH and Tran LS (2013) Những kết quả gần đây về nghiên cứu chức năng gen đậu tương trong điều kiện khô hạn. Hội nghị Khoa học Công nghệ Sinh học Toàn Quốc, Hà Nội, tháng 9, 2013, 2:747-751
  5. Lê Thị Ngọc Quỳnh, Chu Đức Hà, Nguyễn Văn Kết, Lê Tiến Dũng(2015) Lectin thực vật và tiềm năng ứng dụng trong quản lý côn trùng gây hại. Tap Chi Sinh Hoc, 37(2): 170-183
  6. Vũ Tuấn Nam, Chong Chom-Kyu và Lê Tiến Dũng(2015) Quy trình đơn giản sản xuất ADN polymerase và chế phẩm “hot start” ở qui mô phòng thí nghiệm. Tap Chi Sinh hoc, 37(1):124-132
  7. Chu Duc Ha, Le Thi Ngoc Quynh, Nguyen Trong Hien, Le Huy Ham, Le Tien Dung (2015) Thiết lập các chỉ tiêu hình thái đặc trưng cho phân loại các giống sắn (Manihot esculenta Crantz) ở Việt Nam dựa trên mô tả hình thái giống săn KM94. Tap Chi Sinh hoc, 37(1), 31-38
  8. Chu Duc Ha, Le Thi Ngoc Quynh, Nguyen Trong Hien, Pham Thi Ly Thu, Le Huy Ham, Le Tien Dung (2015) Mô tả nhận dạng một số giống sắn phổ biến ở Việt Nam. Tạp chí KHCNNN Việt Nam, 7:10 trang
  9. Chu Duc Ha, Le Thi Ngoc Quynh, Pham Thi Ly Thu, Nguyen Quang Huy and Le Tien Dung (2015) Phân tích gen mã hóa protein giàu Methionine trên cây Arabidopsis thaliana trong điều kiện bất lợi. Tap chi Sinh hoc, 37(4): 487-495
  10. Chu Đức Hà và Lê Tiến Dũng (2015) Vai trò của yếu tố điều hòa cis trong đáp ứng của thực vật với các điều kiện bất lợi. Tap chi Sinh hoc. 37(3):370-383.
  11. Chu Duc Ha, Le Thi Ngoc Quynh, Nguyen Trong Hien, Pham Thi Ly Thu, Le Huy Ham, Le Tien Dung (2016) Morphological characterization and classification of Cassava (Manihot esculenta Crantz) in Vietnam. Tạp chí Sinh học, 38(3):344-351 (English)
  12. Chu Đức Hà, Nguyễn Thị Kim Liên, Phạm Thị Lý Thu, Lê Tiến Dũng, (2016). Xác định họ gen mã hóa enzyme Methionine-s-sulfoxide reductase ở đậu tương (Giycine max). Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam, 9(70): 27-32
  13. Nguyen LT, Vu NT and Le DT (2016) Purification and characterization of recombinant acetohydroxyacid synthase from Heamophilus influazae. Tạp chí Sinh học, 38(3):367-373. (English)
  14. Le DT and Le QN (2017) CRISPR/Cas – Công cụ cải thiện di truyền cây nông nghiệp. Tạp chí KH và CN Việt Nam, 6A:45-47
  15. Chu HD, Wyckhuys K and Le DT (2017) In silico identification and characterization of the lectin gene families in cassava (Manihot esculenta Crantz). Tạp chí Sinh học, 39(3):320-332. (English)
  16. Chu Đức Hà, Nguyễn Thu Trang, Đoàn Thị Hải Dương, Vũ Thị Thu Hiền, Nguyễn Văn Giang, Phạm Thị Lý Thu, Lê Tiến Dũng (2017). Phân tích in silico họ gen mã hóa yếu tố phiên mã Nuclear factor-YB ở cam ngọt (Citrus sinensis). Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam, 3(76): 22-26
  17. Chu Duc Ha, Nguyen Thi Kim Lien, Tran Thi Thanh Huyen, Pham Thi Ly Thu, Le Tien Dung (2017). Computational analysis of the Methionine sulfoxide reductase gene family in soybean (Glycine max) and their response in abiotic stresses. Journal of Science – HNUE, 62(10): 127-133 (English)
  18. Chu Đức Hà, Phạm Thị Quỳnh, Phạm Thị Lý Thu, Nguyễn Văn Cương, Lê Tiến Dũng (2018). Xác định họ gen mã hóa protein vận chuyển SWEET ở cây sắn (Manihot esculenta Crantz). Tạp chí Khoa học – Đại học Sư phạm Hà Nội, 63(3): 140-149
  19. Lê Thị Ngọc Quỳnh, Chu Đức Hà, Lê Tiến Dũng (2018). Tình hình ứng dụng CRISPR/Cas trong cải thiện di truyền cây nông nghiệp. Tạp chí Khoa học và Công nghệ – Đại học Nguyễn Tất Thành, 2: 6-12
  20. Chu Đức Hà, Lê Hùng Lĩnh, Nguyễn Văn Kết, Lê Tiến Dũng, Đỗ Mạnh Cường, Hoàng Thanh Tùng, Dương Tấn Nhựt (2018). Sâm Ngọc Linh – Cây dược liệu quý mang thương hiệu quốc gia. Tạp chí Khoa học & Công nghệ Việt Nam, 1A(706): 32-35
  21. Chu Đức Hà, Lê Bá Ngọc, Lê Tiến Dũng (2018). Saffon – Loại gia vị quý và tiềm năng phát triển ở Việt Nam. Tạp chí Khoa học & Công nghệ Việt Nam, 5A(710): 72-75.
  22. Chu Đức Hà, Nguyễn Văn Giang, Lê Tiến Dũng, Dương Hoa Xô (2018). Tiềm năng ứng dụng của nấm Purpureocillium lilacinum trong kiểm soát bệnh hại cây trồng. Tạp chí Khoa học & Công nghệ Việt Nam, 4A(709): 33-36.
  23. Duc Ha Chu, Buffel Melanie, Tien Dung Le (2018) Functional characterisation of a soybean galactinol synthase gene under various stress conditions. Vietnam Journal of Science Technology and Engineering, 60(3): 33-36 (English, Tiếng Anh)
  24. Chu Đức Hà, Đoàn Thị Nhung, Trần Thị Hoa Mỹ, Nguyễn Thị Minh Nguyệt, Lê Tiến Dũng (2018). RPA – Kỹ thuật mới trong chẩn đoán bệnh hại cây trồng. Tạp chí Khoa học & Công nghệ Việt Nam, 8A(713): 61-64
  25. Chu Đức Hà, Lê Tiến Dũng (2019). Lợi ích của đậu tương lên men “Natto” và vài trò của enzyme nattokinase. Tạp chí Khoa học & Công nghệ Việt Nam, 4A(721): 46-47
  26. Chu Đức Hà, Phùng Thị Thu Hương, Phạm Bích Ngọc, Lê Thị Ngọc Quỳnh, Lê Hùng Lĩnh, Phạm Xuân Hội, Lê Tiến Dũng (2020). Thành tựu của kỹ thuật chỉnh sửa hệ gen trong cải thiện di truyền cây lúa gạo (Oryza sativa). Tạp chí Khoa học và Công nghệ Việt Nam, 3A(732): 57-60.
  27. Vũ Tuấn Nam, Chu Đức Hà, Lê Tiến Dũng (2021) Các phương pháp chẩn đoán bệnh virus trên cà chua (Solanum lycopersicum). Tạp chí KH và CN Việt Nam, 63B(9):48-53

Top